É pá podia deixar-te por aqui mais umas dicas sobre eco condução que eu nunca utilizei nas motas porque gosto de queimar gasolina!

Uma delas é o aproveitamento das inercias.
Houve uma altura em que em cidade a Dulcinea fazia os ultimos 20m antes dos semforos ao relanto e em neutro.
As saidas das autovias igual, chegava a fazer mais de 500m assim.
O resultado viu-se e as medias baicaram um litro, chegando mesmo a fazer 2l baixos por cada centena de km.

Sobre as valvulas....
Não acredito que seja isso.
Acredito mais que seja admissão como os niveis de CO ou uma mostura muito vitaminada.
Esses escapes nao ajudam nada assim como a temperatura da mota parece-me baixa. Os motores modernos gostam de trabalhar quentes o que ajuda a uma melhor combustão. Normalmente os sistemas de gestão do motor tendem a enriquecer a mistura tendo em conta factores como a humidade do ar, a temperatura do ar, a pressão do mesmo na caixa do filtro e a temperatura do motor. Ora se o motor trabalha a uma temperatura que não é a ideal pode haver uma má gestão do mesmo.
Tenta descubrir quantos sensores tem o sistema e tenta verficar visualmente se estão todos.
Por exemplo, no sistema de escape deve haver a famosa sonda lambda que mede o CO, dentro da caixa de ar deve haver outro e por aí fora.
Se te falta algum pode ser que venha daí o problema. Se estão todos falta verificar se estão a trabalhar com os parametros de origem ou correctos.
Por fim, contacta com os aprilianos que conheças para que te recomendem um mecanico que trabalhe bem as Aprilias e põe-te em contacto com ele!