Forma correta é ir travando e descendo as mudanças progressivamente enquanto abrandas, usando o travão de motor e da mota para abrandar. Claro que há o pessoal que gosta de fazer "coasting" à mota, mas acho isso estúpido.
Referente a parar em 2ª/1ª ou neutro depende de cada um, eu normalmente paro em neutro vindo de 2ª em andamento 90% das vezes. Foi hábito que ganhei. Os outros 10% paro em 2-3ª devido a brincadeiras ou paragens de emergência.
Para reduzir mudanças parado é fácil, basta balançares a mota para a frente e trás enquanto reduzes as mudanças. Podes largar um pouco a embraiagem muito brevemente enquanto reduzes que ajuda. Acelerar a mota um pouco também ajuda. (não os dois ao mesmo tempo claro)