Boas,

Não sou a melhor pessoa para te aconselhar talvez pela falta de experiência (tenho carta de mota há 1 ano e tenho a CB500F de 2021 desde janeiro).
No entanto também me debati com essa escolha e posso te dar alguns pontos a teres em conta.
Em termos de fiabilidade não tens muito por onde te debater porque são discutivelmente duas marcas com o mesmo nivel de fiabilidade apesar do pessoal achar que honda dura para sempre 
Em termos de potência, esses 8cv que dizes ter de diferença não é tão pouco assim, em motas de baixa/média cilindrada e com pouco peso fazem diferença.

• A Honda tem o redline às 8500rpm +/- e a yamaha ultrapassa as 12.000 , há quem diga que o fator "diversão" é maior na yamaha.
  
• Em termos de consumos, pelo que vi, apesar de ser uma 300cc, a yamaha é a que bebe mais.
  

Eu posso falar por mim, sou completo maçarico ainda, tirei a carta A2 em Dezembro de 2020 e comprei a mota 0km em janeiro deste ano, já fiz +/- 7500km nela e na altura escolhi-a por ser estar no limite de potência da carta A2 e por pensar que já era uma mota jeitosa para uns tempos. Verdade seja dita, passados uns 5 meses comecei a pensar em trocar para uma maior assim que tire a carta A e é isso que planeio fazer. Não é que a mota seja pasteleira mas aquela sensação de andar muito passa rápido. 
Resumindo, não te preocupes com a pouca experiência ou o peso (que também não é significativo), a CB500F é uma ótima mota para começar. Se calhar a mt03 podes te cansar cedo demais e querer trocar para algo maior.